Что может быть если заглубил коневую шейку, но не сильно, а примерно на 1 см.

Answer 1

Раскопайте. Ничего страшного. Я свою грушку южанку, откапываю и закапываю каждую весну и осень. Она трудно переносит тяжелую глинистую почву.
Она хорошет и цветет.

Answer 2

А мы в зиму наоборот приносим ведро-два земли и высыпаем у корневой шейки на случай бесснежной, но морозной зимы. Весной отгребаем ту землю. Растут деревья и плодоносят хорошо)

Answer 3

Отгребите землю от ствола.
Уровень корневой шейки - это стык корней и низа ствола (только корни должны быть закрыты) .
Сделайте на одном уровне углубление вокруг - будет небольшая лунка, в которой вода при поливе будет задерживаться и постепенно уходить в прикорневом круге.